تشخيص انواع الفطر Cladosporium sp. بواسطة تغاير قطع التقييد لتفاعل البلمرة المتسلسل (RFLP) المحوسب

الملخص

يلعب الفطر Cladosporium  دورا مهما في صحة الانسان فهو احد الفطريات المسببة لامراض الحساسية والربو ومن اكثر الابواغ المحموله في الهواء ، ولاهمية هذه الفطر شملت هذه الدراسة تصميم بادئ عام لتشخيص 25 نوعا تعود للفطر  Cladosporium  طبقا للمناطق المحفوظة في تسلسل القواعد النتروجينية في مواقع وحدات الرايبوسوم 5.8S و 18S و 28S في هذه الانواع. استخدمت طريقة تغاير قطع التقييد لتفاعل البلمرة المتسلسل RFLP) ) لتشخيص 24 نوعا من انواع الفطر التي تم تشخيصها باستخدام البادئ العام  . اجريت جميع التجارب باستخدام برامج البايولوجي الجزيئي على جهاز الحاسوب والتي اظهرت نتائجها فعالية البادئ المصمم في تشخيص 24 نوعا من اصل 25 نوع وايضا امكانية تشخيص والتمييز لثلاثة انواع من الفطريات باستخدام الانزيمات القاطعة المتخصصة على مستوى النوع وهي Cl. halotorenas باستخدام ثلاثة انزيمات متخصصة و Cl. colrandse  باستخدام انزيمين  و Cl. aciculare بانزيم واحد. توفر هذه التقنية طريقة فعالة في فحص مدى كفاءة البادئات المصصمة والمختارة لاجراء تجارب الـ PCR  افتراضيا قبل استخدامها في المختبر وكذلك استخدام طريقة RFLP عن طريق ايجاد الانزيمات القاطعة الخاصة على مستوى النوع لللاجناس المهمة صحيا لاستخدامها في المختبر لاختصار الوقت والجهد ونجاح عمليات تضخيم وتفاعل انزيم البلمرة PCR .