استخدام الجين NADH dehydrogenase 1 في تحديد سلالة الاكياس العدرية في الاغنام والماشية والانسان في محافظة ذي قار، العراق
الشريط الجانبي للمقالة
محتوى المقالة الرئيسي
الملخص
يعد داء المشوكات الحبيبية من الامراض المشتركة يسببه دور يرقي لطفيلي الاكياس العدرية Echinococcus granulosus والذي يعود لمجموعة الديدان الشريطية. يسبب هذا المرض خسائر كبيرة من ناحية صحية وااقتصادية في العراق ويعد الكبد والرئتين من الاماكن العامة المفضلة للاصابة بهذا الطفيلي. هدفت الدراسة الحالية الى استخدام التقنيات الجزيئية في تشخيص سلالة الاكياس العدرية E. granulosus التي تسبب داء المشوكات الحبيبية للانسان والاغنام والماشية في محافظة ذي قار جنوب العراق. تم الحصول على 30 عزلة من هذا الطفيلي 10 منها جمعت من مرضى اجريت لهم عملية جراحية في مستشفى الامام الحسين التعليمي في محافظة ذي قار و 10 عزلات من الاغنام و 10 عزلات من الماشية جمعت من مجازر في محافظة ذي قار جنوب العراق. شخصت هذه العزلات من خلال الدراسة الجزيئية الحالية باستعمال بادىْ مايتوكونديري متخصص للجين mitochondrial dehydrogenase NADH subunit 1 (NAD1) والذي يضم 400 زوج قاعدي في جميع العزلات المختارة. اظهر تتابع sequencing لنواتج PCR لاثني عشر عزلة (4 عزلات لكل مضيف متوسط) بانها تعود الى سلالة الاغنام G1 عدا عزلة واحدة Eg_5، لوحظ اختلافات وراثية طفيفة بين سلالة G1 للعزلات الحالية وسلالة G1 للعزلات المرجعية المتوفرة في بنك الجينات العالمي. كما لوحظ اختلاف في العزلة Eg_5 المعزولة من كبد الاغنام وهي مشابه لسلالة G3 الخاصة بالجاموس. استنتج من الدراسة الحالية بان سلالة الاغنام G1 هي السلالة الشائعة لطفيلي E. granulosus في محافظة ذي قار.
Received 26/11/2019, Accepted 15/3/2020, Published Online First 11/1/2021
تفاصيل المقالة
هذا العمل مرخص بموجب Creative Commons Attribution 4.0 International License.
كيفية الاقتباس
المراجع
Bhutani N, Kajal P. Hepatic echinococcosis: A review. Ann Med Surg. 2018 Dec 1;36:99-105..
Ma X, Zhang L, Wang J, Luo Y. Knowledge Domain and Emerging Trends on Echinococcosis Research: A Scientometric Analysis. Int J Environ Res Public Health. 2019;16(5):842.
Velasco-Tirado V, Alonso-Sardón M, Lopez-Bernus A, Romero-Alegría Á, Burguillo FJ, Muro A, et al. Medical treatment of cystic echinococcosis: systematic review and meta-analysis. BMC Infect Dis. 2018;18(1):306.
Thompson R, McManus D, Eckert J, Gemmell M, Meslin F, Pawlowski Z. Manual on Echinococcus in humans and animals a public health problem of global concern. 2001.
Dybicz M, Borkowski PK, Jonas M, Wasiak D, Małkowski P. First Report of Echinococcus ortleppi in Human Cases of Cystic Echinococcosis in Poland. BioMed Res Int. 2019; Apr 8 2019.
Kinkar L, Laurimäe T, Acosta-Jamett G, Andresiuk V, Balkaya I, Casulli A, et al. Distinguishing Echinococcus granulosus sensu stricto genotypes G1 and G3 with confidence: A practical guide. Infection, Genet Evol. 2018 Oct 1;64:178-84.
Wang N, Wang J, Hu D, Zhong X, Jiang Z, Yang A, et al. Genetic variability of Echinococcus granulosus based on the mitochondrial 16S ribosomal RNA gene. Mito DNA. 2015;26(3):396-401.
Craig P, Mastin A, van Kesteren F, Boufana B. Echinococcus granulosus: epidemiology and state-of-the-art of diagnostics in animals. Vet Parasitol. 2015;213(3-4):132-48.
Pearson M, Le TH, HuaZHANG L, Blair D, Dai TH. Molecular Taxonomy and Strain Analysis in. Cestode Zoonoses: Echinococcosis and Cysticercosis: Emerg Glob Prob. 2002;341:205.
Khademvatan S, Majidiani H, Foroutan M, Tappeh KH, Aryamand S, Khalkhali H. Echinococcus granulosus genotypes in Iran: a systematic review. J Helminthol. 2019;93(2):131-8.
Nakao M, Yanagida T, Okamoto M, Knapp J, Nkouawa A, Sako Y, et al. State-of-the-art Echinococcus and Taenia: phylogenetic taxonomy of human-pathogenic tapeworms and its application to molecular diagnosis. Infect Genet Evol. 2010;10(4):444-52.
Hanifian H, Kambiz D, Tappeh KH, Mohammadzadeh H, Mahmoudlou R. Identification of Echinococcus granulosus strains in isolated hydatid cyst specimens from animals by PCR-RFLP method in West Azerbaijan–Iran. IJP. 2013;8(3):376.
Sharbatkhori M, Mirhendi H, Jex AR, Pangasa A, Campbell BE, Kia EB, et al. Genetic categorization of Echinococcus granulosus from humans and herbivorous hosts in Iran using an integrated mutation scanning‐phylogenetic approach. Electrophoresis. 2009;30(15):2648-55.
Ahmed ME, Salim B, Grobusch MP, Aradaib IE. First molecular characterization of Echinococcus granulosus (sensu stricto) genotype 1 among cattle in Sudan. BMC Vet Res. 2018;14(1):36.
Bowles J, Blair D, McManus DP. Genetic variants within the genus Echinococcus identified by mitochondrial DNA sequencing. Mol. Biochem. Parasitol. 1992;54(2):165-73.
Galeh TM, Spotin A, Mahami-Oskouei M, Carmena D, Rahimi MT, Barac A, et al. The seroprevalence rate and population genetic structure of human cystic echinococcosis in the Middle East: a systematic review and meta-analysis. Int J Surg. 2018;51:39-48.
Hansh WJ, Awad A-HH. Genotyping Study of Hydatid Cyst by Sequences of ITS1–rDNA in Thi-Qar–Southern of Iraq. Int J Curr Microbiol App Sci. 2016;5(8):350-61.
Hama AA, Mero WM, Jubrael JM, editors. Molecular characterization of E. granulosus, first report of sheep strain in Kurdistan-Iraq. 2nd International Conference on Ecological, Environmental and Biological Sciences (EEBS™ 2012) Oct; 2012.
Vahedi A, Mahdavi M, Ghazanchaei A, Shokouhi B. Genotypic characteristics of hydatid cysts isolated from humans in East Azerbaijan Province (2011-2013). J Anal Res Clin Med. 2014;2(3):152-7.
Utuk AE, Simsek S, Koroglu E, McManus DP. Molecular genetic characterization of different isolates of Echinococcus granulosus in east and southeast regions of Turkey. Acta Tropica. 2008;107(2):192-4.
Shahzad W, Abbas A, Munir R, Khan MS, Avais M, Ahmad J, et al. A PCR analysis of prevalence of Echinococcus granulosus genotype G1 in small and large ruminants in three districts of Punjab, Pakistan. Pak J Zool. 2014;46(6).
Aljawady M. Sheep can be infected with more than one strain of Echinococcus granulosus. Asian J Anim Vet Adv. 2009;8(11):2177-80.
Khalf MS, Al–Faham MA, Al-Taie LH, Alhussian HA. Genotyping of Echinococcus granulose in Samples of Iraqi Patients. IOSR J Pharm Biol Sci. 2014;9(3):06-10.
Thys S, Sahibi H, Gabriël S, Rahali T, Lefèvre P, Rhalem A, et al. Community perception and knowledge of cystic echinococcosis in the High Atlas Mountains, Morocco. BMC public health. 2019;19(1):118.