التوصيف الكامل لجين NADH dehydrogenase subunit 1 في الاكياس العدرية البشرية
محتوى المقالة الرئيسي
الملخص
يمتلك طفيلي الاكياس العدرية سلالاتين متشابهتين (G1 و G3) ونظرا للدور البارز الذي تلعبه عائلة جينات نازعات الهيدروجين في التميز بين هاتين السلالاتين، لذا هدفت الدراسة الحالية الى اجراء التوصيف الجزيئي الكامل لاحد ابرز انواع هذه العائلة وهو الجين NAD1 (من شفرة البدء الى الي شفرة التوقف) للاكياس العدرية المعزولة جراحيا من اكباد المرضى (ولمحافظتي البصرة وميسان) في مستشفى الصدر التعليمي في محافظة البصرة، العراق. عزلت الرؤيسات الاولية من الاكياس تحت ظروف معقمة واستخدمت في استخلاص الحامض النووي منقوص الاوكسجين. اذ ضخم التتابع الكامل للجين في عينات الدراسة وانجز التتابع (السكونس) لهما باستخدام بادئات متخصصه. اظهرت نتائج تحليل السكونس المتكرر Consensus sequence امتلاك كل من عينات البصرة و ميسان 1038 زوجا من القواعد وتقع شفرة البدء GTG في الموقع 87-89 وشفرة التوقف TAA في الموقع 978-980. كما اظهرت استدلالات الاحماض الامينية الى وجود 297 حامض اميني لبروتينات عينات البصرة وميسان. فضلا عن ذلك بينت تحاليل المعلومات الحياتية احتواء هذه البروتينات على الحامض الاميني Isoleucine في الموقع 188 (I188) وهو موجود فقط في سلالة الاغنام G1. وان النموذج التركيبي لبروتينات عينات البصرة وميسان اظهر تشابها كبيرا و يقع I188 في الحلزون 10 (α10). بينت الدراسة ولاول مرة على مستوى العراق التوصيف الكامل للجين NAD1 والعائد الى سلالة الاغنام G1 المسببه لمرض الاكياس العدرية البشري.
Received 11/11/2022
Revised 17/04/2023
Accepted 19/04/2023
Published Online First 20/10/2023
تفاصيل المقالة
هذا العمل مرخص بموجب Creative Commons Attribution 4.0 International License.
كيفية الاقتباس
المراجع
Bonelli P, Dei Giudici S, Peruzzu A, Mura L, Santucciu C, Maestrale C, et al. Identification of Echinococcus granulosus Genotypes G1 and G3 by SNPs Genotyping Assays. Pathog. 2021; 10(2): 1-10. https://doi.org/10.3390/pathogens10020125
Ali R, Khan S, Khan M, Adnan M, Ali I, Khan TA, et al. A systematic review of medicinal plants used against Echinococcus granulosus. Plos one. 2020; 15(10): 1-25. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0240456
AL-Asadi SAM, Hansh WJ, Awad A-HH. Employing NADH Dehydrogenase Subunit 1 in the Determination of Echinococcus granulosus Strain in Sheep, Cattle and Human in Thi-Qar Province, Iraq. Baghdad Sci J. 2021; 18(2): 238-46. https://doi.org/10.21123/bsj.2021.18.2.0238
WHO. Working to Overcome the Global Impact of Neglected Tropical Diseases: First WHO Report on Neglected Tropical Diseases. 2020. https://www.who.int/neglected_diseases/resources/9789241564090/en/
Alvi MA, Ohiolei JA, Saqib M, Li L, Tayyab MH, Alvi AA, et al. Echinococcus granulosus (sensu stricto)(G1, G3) and E. ortleppi (G5) in Pakistan: phylogeny, genetic diversity and population structural analysis based on mitochondrial DNA. Parasit Vectors. 2020; 13(1): 1-10. https://doi.org/10.1186/s13071-020-04199-8
Mirbadie S-R, Zivdari M, Kalani H, Vafaei M-R, Izadi S, Jabalameli Z, et al. Molecular identification of Echinococcus granulosus sensu lato by mitochondrial COX1 and SSU-rDNA markers in dogs in the west of Iran. Gene Rep. 2020; 19: 1-6. https://doi.org/10.1016/j.genrep.2020.100616
Bhutani N, Kajal P. Hepatic echinococcosis: A review. Ann Med Surg (Lond). Ann Med Surg. 2018; 36: 99-05. https://doi.org/10.1016/j.amsu.2018.10.032
Santolamazza F, Santoro A, Possenti A, Cacciò S, Casulli A. A validated method to identify Echinococcus granulosus sensu lato at species level. Infect Genet Evol. 2020; 85: 1-5. https://doi.org/10.1016/j.meegid.2020.104575
Wang N, Wang J, Hu D, Zhong X, Jiang Z, Yang A, et al. Genetic variability of Echinococcus granulosus based on the mitochondrial 16S ribosomal RNA gene. Mitochondrial DNA. 2015; 26(3): 396-01. https://doi.org/10.3109/19401736.2013.840590
Kinkar L, Laurimäe T, Sharbatkhori M, Mirhendi H, Kia EB, Ponce-Gordo F, et al. New mitogenome and nuclear evidence on the phylogeny and taxonomy of the highly zoonotic tapeworm Echinococcus granulosus sensu stricto. Infect Genet Evol. 2017; 52: 52-8. https://doi.org/10.1016/j.meegid.2017.04.023
Laurimäe T, Kinkar L, Romig T, Umhang G, Casulli A, Omer RA, et al. Analysis of nad2 and nad5 enables reliable identification of genotypes G6 and G7 within the species complex Echinococcus granulosus sensu lato. Infect Genet Evol. 2019; 74: 1-9. https://doi.org/10.1016/j.meegid.2019.103941
Kinkar L, Laurimäe T, Acosta-Jamett G, Andresiuk V, Balkaya I, Casulli A, et al. Distinguishing Echinococcus granulosus sensu stricto genotypes G1 and G3 with confidence: A practical guide. Infect Genet Evol. 2018; 64: 178-4. https://doi.org/10.1016/j.meegid.2018.06.026
Šnábel V, Kuzmina TA, Antipov AA, Yemets OM, Cavallero S, Miterpáková M, et al. Molecular study of Echinococcus granulosus cestodes in Ukraine and the first genetic identification of Echinococcus granulosus sensu stricto (G1 genotype) in the country. Acta Parasitologica. 2022; 67(1): 244-54. https://doi.org/10.1007/s11686-021-00450-z
Khademvatan S, Majidiani H, Foroutan M, Tappeh KH, Aryamand S, Khalkhali H. Echinococcus granulosus genotypes in Iran: a systematic review. J Helminthol. 2019; 93(2): 131-8. https://doi.org/10.1017/S0022149X18000275
Al-Tikrity IA, AL-Janabi ZA, Al-jubory AH. Comparative study of hydatid cysts isolated from livers of different hosts. Baghdad Sci J. 2014; 11(2): 928-33. https://doi.org/10.21123/bsj.2014.11.2.928-933
Alvi MA, Ohiolei JA, Saqib M, Li L, Tayyab MH, Alvi AA, et al. Echinococcus granulosus (sensu stricto)(G1, G3) and E. ortleppi (G5) in Pakistan: phylogeny, genetic diversity and population structural analysis based on mitochondrial DNA. Parasites vectors. 2020; 13(1): 1-0. https://doi.org/10.1186/s13071-020-04199-8
Nelson DL, Cox MM. Lehninger principles of biochemistry. 6th ed. New York: W.H. Freeman; 2013. 1198p. https://www.whfreeman.com/lehninger6e
Liu HY, Liao PC, Chuang KT, Kao MC. Mitochondrial targeting of human NADH dehydrogenase (ubiquinone) flavoprotein 2 (NDUFV2) and its association with early-onset hypertrophic cardiomyopathy and encephalopathy. J Biomed Sci. 2011; 18(1): 1-7. http://www.jbiomedsci.com/content/18/1/29
Huang L, Jin X, Xia L, Wang X, Yu Y, Liu C, Shao D, Fang N, Meng C. Characterization of mitochondrial NADH dehydrogenase 1α subcomplex 10 variants in cardiac muscles from normal Wistar rats and spontaneously hypertensive rats: Implications in the pathogenesis of hypertension. Mol Med Rep. 2016; 13(1): 961-6. https://doi.org/10.3892/mmr.2015.4607
Murari A, Rhooms SK, Garcia C, Liu T, Li H, Mishra B, et al. Dissecting the concordant and disparate roles of NDUFAF3 and NDUFAF4 in mitochondrial complex I biogenesis. Iscience. 2021; 24(8): 1-26. https://doi.org/10.1016/j.isci.2021.102869
Formosa LE, Muellner-Wong L, Reljic B, Sharpe AJ, Jackson TD, Beilharz TH, et al. Dissecting the roles of mitochondrial complex I intermediate assembly complex factors in the biogenesis of complex I. Cell reports. 2020; 31(3): 1-13. https://doi.org/10.1016/j.celrep.2020.107541