استخدام مؤشرات بصمة الدنا المتضاعف DAF (DNA Amplification Fingerprint) في دراسة التنوع الوراثي للرز Oryza sativa L.
محتوى المقالة الرئيسي
الملخص
اجريت هذه الدراسة لتحليل التنوع الوراثي لـ 10 اصناف من الرز الشائعة في العراق باستخدام واحدة من مؤشرات الدنا DNA markers وهي مؤشرات بصمة الدنا المتضاعف (DNA amplification fingerprint) (DAF). تم تجربة ستة بادئات اظهرت النتائج عدم الحصول على نواتج تضاعف باستخدام البادئات OPT.14 وOPM.5 ، في حين اظهر البادئان OPX.8 و OPT.2 حزم مشتركة بين جميع الاصناف المدروسة. اما البادئان OPN.7 وOPX.1 فقد اظهرا نواتج تضاعف متباينة بين الاصناف المدروسة. وكان عدد الحزم الناتجة من استخدام احدهما (OPN.7) 16 حزمة، ولقد تم ايجاد 10 نسق وراثي كان متميزاً في الاصناف العشرة من الرز مما امكن تمييزهم باستخدام هذا البادئ وايجاد البصمة الوراثية لهذه الاصناف، اما عدد الحزم الناتجة من استخدام البادئ الثاني OPX.1 فكان 13 حزمة. ولقد انتج هذا البادئ 8 انواع من انواع النسق كان متميزاً لستة اصناف امكن تمييزها وايجاد البصمة الوراثية لها باستخدامه ومن هذا يستنتج امكانية تشخيص الاصناف العشرة المدروسة بتطبيق مؤشرات الـ DAF باستخدام بادئين فقط مما يدل على زيادة المعلومات التي يمكن الحصول عليها باستخدام عدد قليل من البادئات في هذا النوع من المؤشرات.
تفاصيل المقالة
هذا العمل مرخص بموجب Creative Commons Attribution 4.0 International License.
كيفية الاقتباس
المراجع
Karp, A., Edwards, K.J., Buford, M., Funk. S., Vosman, B., Morgante, M. and Hewitt, G.M. 1997, Molecular technologies for biodiversity evaluation: opportunities and techniquies. Nature Biotechnology.15:625-628.
Tilman, D., Wedin, D. and Knopps, J. 1996, Productivity and sustainability influenced by biodiversity in grassland ecosystems. Nature.379:718-720.
Karp, A. and Edwards, K.J. 1997, DNA Markers: a global overview, In: Caetano-Anolles, G. and Gresshoff, P.M. (Eds) DNA markers, Protocols, Application and Overview. Now York.:1-13.
Staub, J.E., Serquen, F.C. and Gupta, M. 1997, Genetic markers, map construction and their application in plant breeding. Hort. Sci. 31:729-741.
Stuber, C.W. and Khanna, K.R. 1991, Isozyme markers and their significance in crop improvement. Biochemical aspects of crop improvement. CRC Press, Boca Raton, USA.:59-77.
Kraic, J., Horvath, L., Gregova, E. and Zak, I. 1995, Standard methods for electrophoretic separation of wheat glutenins and gliadins by SDS-PAGE. Rostl Vyr. 41:219-223.
Paterson, A.H., Tanksly, S.D. and Sorrell, M.E. 2004, DNA Markers in plant improvement. Adv. Agron.46:39-90.
Caetano-Anolles, G., Bassam, B.J. and Gresshoff, P.M. 1991, DNA amplification fingerprinting using very short arbitrary oligonucleotide primers. Biotechnology. 9:553-557.
Wilde, J. Waugh, R. and Powell, W. 1992, Genetic fingerprinting of Theobroma clones using randomly amplified polymorphic DNA markers. Theor. Appl. Genet. 83:871-877.
Caetano-Anolles, G. and Gresshoff, P.M. 1996, A method for profiling nucleic acid of unknown sequence using arbitrary oligonucleotide primers US. Patent. 5:413-414.
Jarret, R.L. and Austin, D.F. 1994, Genetic diversity and systematic relationship in sweet potato (Ipomoea batatas) and related species as revealed by RAPD analysis. Genet. Res. Crop. Evol.41:165-173.
He, G., Prakash, C.S. and Jarret, R.L. 1997, Analysis of genetic diversity in sweet potato (Ipomoea batatas) germplasm collection using DNA amplification fingerprinting. Genome. 38:938-945.
Weigand, F., Baum, M. and Udupa, S. 1993, DNA molecular marker techniques. Technical manual. No.20 International Center for Agricultural Research in the Dry Areas, Aleppo, Syria.
Sahgi-Maroof, M.A., Soliman, K.M., Jorgens, R.A. and Allard, R.W. 1984, Ribosomal DNA spacer length polymorphisms in barley, Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 81:8014-8018.
Al-Judy, N.J. 2004, Detecting of DNA fingerprints and genetic relationship analysis in local and Improved Rice (Oryza sativa L.) varieties in Iraq using RAPD markers. Ph.D. a thesis. Baghdad University. College of Science.
Sambrook, J., Fritsch, E.F. and Maniatis, T. 1989, Molecular cloning: a laboratory manual. 2nd. Cold spring Harbor. N.Y.
Caetano-Arolles, G., Bassam, B.J. and Gresshoff, P.M. 1994, DNA amplification fingerprinting with very short primers. Plant Mol. Biol. Rep.19:18-25.
Bassam, B.J., Caetano-Arolles, G. and Gresshoff, P.M. 1991, Fast and Sensitive silver staining of DNA in polyacrylamide gels. Anal. Biochem. 38:70-76.
Trigiano, R., Caetano-Anolles, G., Bassam, B.J., Weaver, K.R. and Gresshoff, P.M. 2002, DNA amplification fingerprinting of doywood anthracnose Fungi Proc. South. Nurs. Assn. 15:10-17.
He, G. and Prakash, C.S. 1997, Identification of polymorphic DNA markers in cultivated peanut (Arachis hypogaea L.) Euphytica,. 97:143-149.
Bassam, B.J., Caetano-Anolles, G. and Gresshoff, P.M. 1992, DNA amplification fingerprinting of bacteria. Appl. Microbiol. Biotech. 38:70-76.